Промени в разпространението на серотипа на Streptococcus pneumoniae в Саутхемптън, Обединеното кралство между 2006 и 2018 г.

Между зимите на 2006/07 и 2017/18, от общо 4409 участници в проучването, 4393 деца, чиято възраст беше точно записана като < 5 години, предоставиха NP тампони (n = 4393) за микробиологично изследване. Демографските данни на изследваната популация са дадени в допълнителна таблица 1. Разбивката на разпространението на колонизация по възрастова група на година със статус на колонизация е показана на допълнителна фигура. 1. Общо 1429 (32,5%) тампона са дали пневмококи. Пневмококовото носителство за всяка година на изследване е показано на фиг. 1. Пренасянето варира от нисък 27,8% (95%CI 23,7–32,7) през година 3 (2008/09) до висок през година 9 (2014/15) от 37,9% (95%CI 32,8–43,2).

Фигури 1

Разпространение на носителството (%) на S. pneumoniae (всички серотипове) през всяка година от изследването. Общият превоз остава постоянен при средно 32,5%, вариращ от 27,8% през 2008/09 до 37,9% през 2014/15. Въвеждането на PCV13 е показано с вертикална линия. Лентите за грешки представляват 95% CI.

Пневмококовото носителство по възрастови групи е показано на фиг. 2. Участниците бяха разделени на възрастови групи, както следва: < 6 месеца (n = 1009, 23,0%), 7–11 месеца (n = 644, 14,6%), 12–23 месеца (n = 1148, 26,1%), 24 –35 месеца (n = 741, 16,9%), 36–47 месеца (n = 567, 12,9%) и 48–60 месеца (n = 284, 6,5%). Анализите на тенденциите показват, че носенето се увеличава с времето при деца на възраст 24–35 месеца (стр < 0,001) и 47–60 месеца (стр < 0,05). След това поставихме под въпрос дали тези промени в превоза се дължат на замяната на PCV7 с PCV13 между четвъртата и петата година (2009/10 и 2010/11) (фиг. 3). Както е показано на фиг. 3A, нямаше значително увеличение на пренасянето, когато всички участници бяха групирани в PCV7 или PCV13 ера (стр = 0,094). Въпреки това, при индивидуално изследване на възрастовите групи (фиг. 3B) тук отново се забелязва значително увеличение на носителството при тези на възраст 24–35 месеца в PCV13 в сравнение с ерата на PCV7 (стр = 0,004).

Фигури 2
фигура 2

Разпространение на носителството (%) на S. pneumoniae (всички серотипове) по възрастова група и година. Въвеждането на PCV13 е показано с вертикална линия. Лентите за грешки представляват 95% CI. Статистически значими увеличения на превоза при тези на възраст 24-35 (стр< 0,001) и 48–60 (стр< 0,05) месеца са показани чрез тест Хи-квадрат за промени в тенденциите на пропорцията.

Фигура 3
фигура 3

Сравнение на общото разпространение на пневмококово носителство (%) по PCV ера за всички възрасти (А). и във възрастови групи (б). Като цяло не е открита статистически значима разлика между PCV7 и PCV13 ерата, с изключение на тези на възраст 24-35 месеца, при които е наблюдавано значително увеличение на носителството в PCV13 ерата (стр< 0,05).

Разпределението на пренасяните серотипове, според включването им в PCV7 или PCV13, е показано на фиг. 4.

Фигури 4
фигура 4

Съотношение на серотип за всички S. pneumoniaeизолиран между 2006/07 и 2017/18. Серотиповете са оцветени според PCV, в който са включени в момента (PCV13), включени преди (PCV7) или включени в новоразрешени формулировки (PCV20). Серотипове, които не са в PCV, са показани в жълто.

Следователно тези серотипове, които ще бъдат насочени като част от PCV20, който се очаква да бъде част от графика за детството в бъдеще, също са показани. Най-разпространените PCV7 серотипове са 6B (n = 46, 3,4%), 19F (n = 27, 2,0%) и 23F (n = 25, 1,8%). От PCV13 най-изолирани са 6A (n = 42, 3.1%) и 19A (n = 40, 2.9%). NVT серотипове 15B/C и 11A са най-често изолирани като цяло при 10,9% (n = 148) и 9,6% (n = 131) съответно.

Не се наблюдава значителна промяна в серотиповото разнообразие, измерено с помощта на Simpsons 1-D. Стойностите варират от 0,90 през 2006/07 до 0,94 през 2008/09 и 2009/10, със средна стойност от 0,93. Когато се групират във връзка с PCV (фиг. 5), намаляването на серотиповете PCV7 и PCV13 след въвеждането на PCV7 и PCV13 е ясно, със съпътстващото увеличение на серотиповете NVT, което през 2017/18 г. се равнява на > 95% от носителството.

Фигура 5
фигура 5

Разпространение на серотипове, групирани по включване в PCV, като се отбелязва намаляването на серотипове PCV7 след PCV7 от > 50% (лилаво) и на серотипове PCV13 (синьо) от високо ниво от ~ 20% след PCV13. Заместването на серотипа с NVTs, тук разделено, за да илюстрира тези, които ще бъдат насочени към PCV20, се равнява на 95% от носителството през 2017/18.

Тази промяна беше очевидна при изследване на пропорцията след PCV7/преди PCV13 и след PCV13 на всеки серотип поотделно, както е показано на фиг. 6. Носителството на всички PCV серотипове намалява значително след въвеждането на PCV7 и/или PCV13. Изключение е серотип 3, където относителната честота е подобна между епохите (преди PCV13 n = 7, 1,67%; след PCV13 n = 13, 1,27%). NVTs показват като цяло обратното с увеличаване на честотата след въвеждането на PCV. Забележителни изключения бяха 22F и 6C, които намаляха в периода след PCV през последните години. От 2010/11 г. са изолирани n = 47 изолата на серотип PCV7 или PCV13 (фиг. 7) и включват серотипове 6B и 19F от PCV7 и 3, 5, 6A, 7F и 19A от PCV13. Не е виждан вагон с 5, 6B или 6A от 2012/13 г. Единични случаи на пренасяне на 7F се случиха през 2014/15 и 2016/17, но 19A и 3 бяха изолирани през повечето години (n = 7 и n = 5 съответно от 2014/15 включително).

Фигура 6
фигура 6

Разлики в съотношението на серотипа между ерата след PCV7/преди PCV13 (лилаво) и ерата след PCV13 (жълто). Всички PCV серотипове показват значително намаление поради прилагането на PCV, с изключение на серотип 3, който също е намалял, но в по-малка степен. Забележителни изключения от увеличението на NVT са 22F и 6C, които също са намалели в ерата след PCV13, въпреки че това е последвало по-ранни разширения.

Фигура 7
фигура 7

Изолиране на серотипове от тип PCV след въвеждането на PCV13 през 2010 г. Серотипове 5, 6B, 6A не са изолирани от 2012/13 г. През последните години 19A и 3 са най-често изолираните PCV серотипове (съответно n = 7 и n = 5).

Влиянието на дозата PCV беше изследвано във връзка с носителството (фиг. 8). Отново, чрез изследване на периодите след PCV7/преди PCV13 (фиг. 8A) и след PCV13 (фиг. 8B) поотделно, се наблюдава статистически значимо увеличение на носителството при деца, за които се очаква да са получили многократни дози: една срещу. три дози стр= 0,0021, тези vs. две дози стр= 0,0021 и две срещу. три дози стр= 0,026. Въпреки че се наблюдава подобна тенденция за PCV7, по-малкият брой означава, че това не е значимо.

Фигури 8
фигура 8

Въздействие на изчисления брой PCV дози върху пневмококовото носителство на PCV7 (А.) и PCV13 (б.). Носителството като съотношение на броя на децата във всяка дозова категория е значително по-високо, тъй като броят на дозите се увеличава за PCV13, но не и за PCV7. Лентите за грешки представляват 95% CI. Показаните стойности на значимост са от сравнението на средните стойности на Kruskal–Wallis.

Коефициентите на S. pneumoniaeносителството е изследвано във връзка с възрастта, пола, ваксинациите, заболяването през 30-те дни преди вземането на тампон и употребата на антибиотици през същия период (фиг. 9). Въздействието на увеличаването на възрастта се наблюдава и при тези на възраст 7–11 и 12–23 месеца с повишен шанс за носителство (1,90, 95% CI 1,18–3,06, стр= 0,008 & 2,72, 95% CI 1,44–5,16, стр= 0,002 съответно) по отношение на тези < 6 месеца. Тези, които съобщават за подобно на настинка заболяване през предходните 30 дни, са значително по-склонни да бъдат положителни за пневмококи (OR 1,74, 95% CI 1,37–2,21, стр< 0,001). За разлика от тях, тези, които са получавали антибиотици, са по-малко склонни да бъдат носители S. pneumoniae(0,68, 95% CI 0,46–1,00), въпреки че при стр= 0,051 това не е преминало прага на значимост. Не са наблюдавани други значими връзки.

Фигури 9
фигура 9

Горски график, показващ променливи, свързани с пневмококово носителство. Коефициентите бяха изчислени с помощта на многопроменлив логистичен регресионен модел. Участниците, съобщаващи за настинка през предходните 30 дни, са значително по-склонни да носят S. pneumoniae(ИЛИ 1.73:1.36–2.21, стр< 0,001). Възрастовите групи 7–11 и 12–23 месеца също са по-склонни да бъдат носители на пневмококи в сравнение с тези на възраст < 6 месеца.

Leave a Comment