Секвенирането на целия геном може да помогне за поставяне на точна диагноза на тежко болни бебета

Децата, които са родени тежко болни или развиват сериозно заболяване през първите няколко седмици от живота, често са трудни за диагностициране, което има значителни последици за техните краткосрочни и дългосрочни грижи.

Но секвениране на целия геном (WGS), извършена бързо, може да осигури точна диагноза и следователно да доведе до подобрения в клиничните грижи. Резултатите от австралийско проучване за такова използване на WGS, представено на годишната конференция на Европейското дружество по човешка генетика днес (неделя), показват как интегрирането на геномни, транскриптомни и функционални данни може да ускори диагностицирането на редки заболявания в национален мащаб.

Доказателствата за диагностична, клинична и семейна полза от бързото геномно тестване при критично болни деца са огромни. Този вид изследване трябва да стане стандарт за грижа за тези пациенти. А програмите за бърза геномна диагностика трябва да продължат да стимулират подобрение, иновации и открития в по-широк план.”

Зорница Старк, професор и клиничен генетик, Викториански служби за клинична генетика и австралийска геномика, Европейско дружество по човешка генетика

Изследователите проведоха национален ултра-бърз WGS при 290 критично болни педиатрични пациенти с рядко заболяване между януари 2020 г. и януари 2022 г. Те имаха за цел да имат диагнози за по-малко от пет дни. „Искахме програмата да служи като пример за това как геномиката може да подобри диагностичните и клиничните резултати при педиатричните заболявания в реално време“, казва проф. Старк. “Сега сме включили РНК секвениране и чрез тясно сътрудничество с клиницисти и изследователи оптимизирахме използването на функционални данни, за да осигурим допълнителни диагнози.”

Ултра-бързият WGS доведе до диагноза при 136 пациенти, със средно време за диагностициране малко под три дни. От 154 пациенти, които не са диагностицирани чрез стандартен WGS анализ, РНК секвенирането, функционалните анализи и други тестове доведоха до допълнителни 20 диагнози. Нови болестотворни гени също са идентифицирани чрез международни усилия за сватовство и се провеждат проучвания за намиране на допълнителни диагнози.

Въпреки че цената на геномното тестване остава висока в сравнение с други диагностични изследвания, особено при предоставяне на резултати в бързи срокове, използването му осигурява значителни спестявания на здравните системи в дългосрочен план. Сложните, критични във времето тестове, като ултра бързите WGS, се извършват най-добре от мултидисциплинарен екип, а това означава, че както капацитетът, така и капацитетът на работната сила в клиничната и лабораторната генетика трябва да бъдат нараснали, казва проф. Старк.

„Нашият подход може да послужи като модел в други системи на здравеопазване, въпреки че ще трябва да бъде адаптиран към местните обстоятелства и да се развива с течение на времето. Например, Австралия има много географски разпръснато население, което е сравнително малко в сравнение с земната площ. за нас имаше смисъл да имаме централна лаборатория за секвениране за това изследване, като се отделя много внимание на транспортната логистика на пробите и на включването на местни екипи в анализа чрез виртуални срещи. Ще са необходими различни модели в страни с висока гъстота на населението.

„Несъмнено има и възрастни с редки заболявания, които биха се възползвали от ултра бързата геномна диагностика, но бяха изключени от проучването“, казва проф. Старк. Услугите по клинична генетика традиционно са били много по-ангажирани в предоставянето на консултации в отделенията за интензивно лечение на новородени и педиатри, като улесняват идентифицирането на пациенти, които биха се възползвали от бързото геномно тестване, така че повишаването на осведомеността за геномиката в интензивните грижи за възрастни ще бъде предизвикателство за разширяване достъп.

Намесени са и етичните въпроси, особено около съгласието. Семействата са претоварени и изнервени, когато детето им е критично болно, така че как най-добре да се улесни информираното съгласие е проблем? Наистина ли винаги е необходимо съгласие? Може ли да бъде задържано? Как диагнозата на генетично заболяване трябва да повлияе на решенията от лекуващите клиницисти и от семействата? Дали бързото геномно тестване е честно използване на ресурсите? Всичко това са важни и трудни въпроси.

„Все още има много предизвикателства, пред които трябва да се изправим, не на последно място намирането на начин за бързо прехвърляне на успешни изследователски програми в клинична среда, но ние вярваме, че нашата работа показа, че свръхбързата WGS има диагностична, клинична и икономическа полза на национално ниво “, казва проф. Старк. “Надяваме се, че нашият подход скоро ще стане част от масовата диагностична практика не само в Австралия, но и по-далеч.”

.

Leave a Comment